一、皮部出现的生物病害
　　
　　1、裂果
　　
　　症状与病因果实接近成熟时，在果蒂附近发生放射状裂痕，果肩部出现同心圆状的龟裂。这是由于果实的肩部受到阳光直射而造成老化，加之室内温度较高，致使果皮和果肉迅速膨大所致。另外，土壤中缺少钙和硼也会引起老化，造成裂果。
　　
　　防治方法在定植时，将番茄的花序安排在畦内侧，垄向由南向北，这样叶片可对果实起到遮荫作用，并且通风透光好；加强管理，经常保持室内适宜的温湿度，防止室内高温低湿；同时还要及时补充钙肥和硼肥，捉使植株健壮生长。
　　
　　
　　
　　2、脐腐果
　　
　　症状与病因在花朵脱落处变成油浸状，脐部逐步变成褐色凹陷，果实早熟变红。水分供应失常是诱发此病的主要原因。缺钙或钙吸收不良时，一方面会造成植株体内草酸增多，另一方面使脐部细胞生理紊乱，也会造成蒂腐发生。
　　
　　防治方法在加强水肥管理的同时，开花期可用浓度10g/kg的过磷酸钙或1一5g/kg的氯化钙溶液喷洒叶面，增加植株对钙的吸收。可通过摘心叶，促使植株吸收的钙转入到果实中去；由于果实间对钙的吸收有竞争性，应避免植株结果太多。同时要防止土壤干燥，多钾高湿的环境也不利于植株对钙的吸收。
　　
　3、着色不良果
　　
　　症状与病因番茄着色是由于叶绿素分解形成茄红素的缘故，光照不足只能使果实着色缓慢，而不是着色不好。如果氮肥过多，叶绿素就会增多，分解形成茄红素的过程就会推迟，使果实着色不好。但在氮、钾肥少时，叶绿素分解形成茄红素的过程也会受到影响，使果实着色不良。温度也是影响着色不良的原因，高温还会导致着色不良，形成黄色果实。
　　
　　防治方法在合理施用氮、锌肥的同时，要保持室内适宜的温度，一般在果实膨大前期夜间温度不能低于5--10℃，果实膨大的后期是着色期，气温必须在15℃左右。
　　
　　二、果形上的生理病害
　　
　　1、尖头果
　　
　　症状与病因在使用植物生长激素时浓度过高或进行浸花、喷花等处理方法不当时容易形成尖头果，心室较多的番茄品种发病较重。
　　
　　防治方法在使用植物生长激素时要掌握好溶液浓度，一般2，4-D为l0--20mg/kg，番茄灵为25--50mg/kg，番茄丰产剂为l0ml加水稀释50一70倍。但在生产中应尽量少用2,4-D处理，而使用番茄灵可有效地防止尖头果的发生。
　　
　2、畸形果
　　
　　症状与病因一般心室较多的番茄品种易发生畸形果，氮肥和磷肥过多而硼和钙含量过少时也易产生多心室的畸形果，其中椭圆形、偏心形和菊形果的产生与缺钙和缺硼有关。夜间高温高湿更能促进畸形果的发生，低温也会造成果形的变化。
　　
　　防治方法定植前要施足充分腐熟的有机肥，保证土壤中钙和硼元素的含量，避兔土壤中水分发生急剧变化，夜间气温要保持在15℃左右。另外，用生长激素溶液涂抹初开花的花柄，也可防止畸形果的产生。
　　
　　3、顶裂果
　　
　　症状与病因一般在花柱痕迹的中心处开裂。心室较多的果实易发生顶裂果，其发生还与钙有关。另外，夜间低温、白天35℃以上的高温也会加速顶裂果的形成。
　　
　　防治方法注意合理施肥，少施氮、磷肥，补施钙、钾肥；加强温湿度的管理，及时中耕除草，夜间温度保持在10--15℃，白天温度最高不能超过28℃，可有效地预防番茄顶裂果的发生。
　　
　　三、果实内部出现的生理病害
　　
　1、空洞果
　　
　　症状与病因花芽发育过程中的高温和日照不足，常使花粉不成熟、受精不良，种子形成时产生的果酸较少，此时会形成空洞果。果肉部与果腔部发育速度相差过大而使二者之间出现空隙，也会形成空洞果。生长激素浓度过高、处理过早及水肥供应不足、营养物质供应不良时，也易产生空洞果。同一花序中迟开花形成的果实，易形成空洞果。
　　
　　防治方法促进植株旺盛生长，使果实能得到充足的养分，可减少空洞果的发生。在同一花序上对同时开放的3一4朵花用生长激素进行处理。
　　
　2、酸浆果
　　
　　症状与病因在花期温度、光照不良时，对本来要落的花用生长素处理后虽能勉强结果，但养分供应不足，致使产生酸浆果。生长素处理浓度过大或重复处理也会形成酸浆果。

      防治方法在加强水肥管理的同时，要特别注意生长素处理的浓度，2，4-D用量一般为10一20mg/kg。在涂抹药液时为防重蘸，药液中应加红色或墨汁以示标记。