由于多年来在农业种植业的生产过程中，长期不合理地增施、使用无机肥料，少施或不施用有机肥料，已使我们赖以生存的耕地的生产能力严重下降。全国土壤普查结果表明：目前我国很大部分的农用耕地土壤中的有机质含量已低于警戒线，土地大面积出现严重板结,土壤肥力已亮红灯。
　　
为此中央高度重视,在今年的中央一号文件中再次明确提出：“科学施用化肥，引导增施有机肥，全面提升地力”。
有机肥种类很多：其中最大项是畜禽粪尿与作物秸秆,还有绿肥、饼粕、草木灰、污泥、生活垃圾与污水等等，畜禽粪尿除少量用于燃料与工业原料外，大部分可用于有机肥，畜禽粪尿发酵处理直接施用。    
南方常见的有机肥主要是畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥，畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥有很多优点也存在弊端。长期以来，广大农业生产用户都只注意它的优点而忽略了畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥的弊端，导致出现了很多问题，产生较大经济损失也不知到是什么原因造成的，长期大量使用畜禽粪肥对环境和农产品质量都会造成威胁，还可能对人体健康或其它生物产生潜在威胁。所以在施用时一定要特别注意其对土壤和作物的不利影响，降低有机肥使用中的安全隐患。下面主要为广大农民朋友介绍畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥的弊端与优势，以供参考。
　　
一、畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥的弊端
南方常见的畜禽粪肥是鸡、鸭、鹅粪和白鸽粪或以鸡、鸭、鹅粪和白鸽粪为主要原料的有机肥。
　　
畜禽粪肥在不同程度上对作物及土壤都会造成不良的影响，为了使广大农友加深对鸡、鸭、鹅粪和白鸽粪或以鸡、鸭、鹅粪和白鸽粪为主要原料的有机肥的认识，并进一步更好的选择有机肥品种和掌握有机肥的施用方法，降低有机肥使用中的安全隐患。现就畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥的弊端概述如下：
1、畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥含盐分较重、易使土壤盐化，升高土壤盐浓度，提高营养元素对农作物的肥效临界点，增大施肥量。严重时会导致种子不发芽、烧苗、烧根；
2、畜禽粪肥的氮是以尿酸形态氮为主，尿酸盐不能直接被作物吸收利用，它在土壤中分解时消耗大量的氧气，释放出二氧化碳气，故易伤害作物根部；
3、畜禽粪肥中可以检出芽胞杆菌属、大肠杆菌以及十多个属的真菌和一些寄生虫等，自身带较多病菌、虫卵，还易引病虫害；
4、部分畜禽粪肥存在着微量元素含量超标的问题。在畜禽饲料中，由于大量添加铜、铁、锌、锰、钴、硒和碘等微量元素，使得许多未被畜禽吸收的微量元素积累在畜禽粪便中。根据有关单位调查，一些大中型畜禽养殖场所使用的饲料中，重金属污染比较严重，铜、锌、铬、铅和镉的含量普遍超过国家饲料卫生标准或无公害生产饲料标准，尤其砷和汞等毒害元素也个别超标；
5、大部分畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥呈酸性，易生病菌，须用石灰中和，致土壤板结；
6、畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥肥性较热，在高温天气使用，易烧苗烧根；
7、畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥需要堆沤腐熟后使用、人工多，周期长；
8、畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥因杂质较多，纯度偏差极大，含量极不稳定，无法保证施用养分含量及效果。
此外，由于管理不善，肥料用量和施用方法不当等因素都会不可避免的造成土壤、空气的污染，而危害人体健康，形成很大的负面影响。主要表现为：
其一、畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥中的芽胞杆菌属、大肠杆菌以及十多个属的真菌和一些寄生虫等病菌随植物残体以有机肥方式施入土壤或经雨水冲洗进入土壤，传染给作物，造成对土壤的生物污染及人、畜身体健康的影响；
其二、畜禽粪肥中的微量元素含量超标的问题，尤其铜、砷和汞等毒害元素也个别超标，造成对土壤的重金属污染，导致蔬菜、水果重金属含量超标，对绿色食品安全造成威胁。
其三、畜禽粪肥中的硫化氢等有害气体挥发产生恶臭，造成空气环境污染。
其四、畜禽粪肥中的盐分使土壤盐化，造成土壤可耕作性能退化。
为此，畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥施用必须特别注意，不管施用畜禽粪肥还是畜禽粪肥为主要原料的有机肥，施用不当或滥施均会对作物、土壤及环境产生不良影响，应加深对其认识，及早做好预防及补救措施。下面以鸡粪及猪粪为例分别说明施用畜禽粪肥或以畜禽粪肥为主要原料的有机肥对作物及土壤的不利之处。
（1）新鲜鸡粪中的氮主要为尿酸盐类，这种盐类不易被作物直接吸收利用，而且对作物根系的生长有害。因此，该类粪肥施用前应先堆积发酵腐熟方可施用。鸡粪发酵温度高，易伤植物幼根，新鲜粪便一般不宜直接施用，需加入污水或与其它有机肥料作堆肥混合堆积，经过堆沤充分腐熟后才能施用。尤其要注意的是，由于鸡饲料中的添加剂含激素成份很高，应该通过堆制进行脱激素处理；同时，鸡粪尿中易带有蛔虫卵，因此需要通过也需要堆制40天左右进行杀灭。所以，建议禽粪在常温下堆制60天，可安全用于无污染蔬菜生产，但冬季堆沤由于气温低，比夏秋季堆沤时间要延长２个月。此外，还要提醒农友们注意的是，施用鸡粪时宜与土充分混匀，不宜施得太厚，以免伤根；鸡粪施入要均匀，只有这样才能使植株长势匀一，便于管理；定植时根系千万不能与鸡粪直接接触，当排水沟土培上畦背时，最好有10~20厘米的隔离层。（2）猪粪中也含有蛔虫卵，且需要50天左右才能对其进行杀灭；其添加剂中激素成分也很高，亦需通过堆制进行脱激素处理，牛粪堆沤则需２０天以上，因此，建议农民朋友施用畜粪肥前应在常温下堆制60天，即可安全用于无污染蔬菜生产，但在冬季堆沤由于气温低，比夏秋季堆沤时间要延长２个月。
二、有机肥的优势
当然，有机肥原料畜禽粪肥经过腐熟后得到的有机肥产品与普通化肥相比仍然具有其独特优势。现就常见的农用有机肥的优势分述如下：
1、养分齐全，促进作物增产增收：有机肥由于含有丰富的有机质，可以全面提供作物氮磷钾及多种中微量元素，大幅度提高农产品的品质，施用后瓜菜甜，米饭香，而且可以有效改善土壤理化性状，疏松土壤，增强土壤透气性，大幅提高地力。生物有机肥成分中含有如固氮菌、解磷菌、解钾菌等，施用后可转化土壤中的营养物质为作物所用，源源不断给作物供应养分。
2、生物活性物质丰富，可促进作物生长：有机肥的施用会使大量有益活性菌迅速繁殖，可有效抑制有害微生物的生长，同时产生多种酶，促进作物健壮生长，增强作物的抗逆和抗病虫害能力，减少农药施用量，缓解连作障碍。
3、改善地力，推动循环农业发展：大量有益活性菌直接参与土壤物质和能量转化、腐殖质形成和分解等过程，对土壤团粒结构起到胶粘作用，有效改善土壤物理性状，增强土壤的透气、保水、保肥能力，防止土壤板结和酸化，培肥地力，提高肥料利用率，降低施肥成本，使土地实现良性循环。
鉴于有机肥原料存在上述优缺点，建议农友们在使用这些有机肥时一定要做到充分腐熟，如果条件允许最好选用当前市面上比较有信誉的大规模工业化生产的商品有机肥。